Zero est soupçonné à tort du meurtre de Shizuka Hiô, une vampire de sang pur, et condamné à mort par le Sénat, haut conseil des vampires. Mais Kaname intervient en sa faveur. Sauvé de justesse, Zero apprend que Shizuka n'était pas l'ennemie qu'il s'était imaginé, mais un pion contrôle par une autre éminence grise. De son côté Yûki, persuadée que sa mémoire effacée contient les clefs de la tragédie, s'efforce de retrouver des traces de son passé. Le voile s'apprête à se lever sur les mystères de chacun mais seront ils prêts à accepter l'horrible vérité ?