Un an après la fin de la première saison, la société est toujours régie par le « Psycho Pass », un procédé de numérisation des émotions et des inclinaisons psychologiques humaines. Au sein de la brigade de Sécurité Publique, chargée d'arrêter les criminels qui enfreignent cette réglementation numérique, l'inspecteur Akane Tsunemori et ses équipiers vont de nouveau être confrontés à des « incidents », qui les amèneront à s'interroger sur « la justice et la société