Ryuta Sakamoto est un joueur de Btooom âgé de vingt-deux ans et sans emploi. Il a la prétention de devenir numéro un mondial à ce jeu populaire, qui a été vendu à plus de trois millions d'exemplaires dans le monde. Il repose sur l'élimination des adversaires par l'utilisation de huit types de bombes, appelées BIM, et d'un sonar afin de détecter la position de l'ennemi. Ryuta se réveille un jour au milieu d'une forêt tropicale. Ne se souvenant pas comment il a atterri là, il découvre qu'il a un cristal implanté dans la main gauche et que son sac contient une sacoche ne lui appartenant pas. Alors qu'il rencontre un autre homme et cherche à comprendre ce qu'il se passe, il se fait attaquer par ce dernier qui lui jette des bombes. Utilisant celles que contenait la sacoche, Ryuta se voit contraint de riposter. Il va alors être plongé malgré lui dans une bataille qui ressemble fortement à son jeu favori, à la différence que cette fois, il devra combattre pour survivre.